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        生物資訊

        毒理學(xué)家擁抱干細(xì)胞

        作者:高大海 姜天海 /譯 來(lái)源:科學(xué)新聞增刊 Alan Dove 發(fā)布時(shí)間: 2014-11-14 10:28  瀏覽次數(shù):
        購(gòu)買進(jìn)口儀器、試劑和耗材——就在始于2001年的畢特博生物 effectnews.cn

         

        藥物研究人員反復(fù)做著一個(gè)噩夢(mèng):他們花費(fèi)數(shù)年和數(shù)十億美元研發(fā)了一個(gè)新藥,小心翼翼地通過(guò)臨床前和臨床試驗(yàn),最終獲得政府的許可,得以面向患者。突然,這種藥物組分開(kāi)始傷害那些本該獲得幫助的人。一項(xiàng)新療法的未來(lái)瞬間崩塌,他們又陷入了失去研究資助和訴訟的困境中。
         
        “如果你回首過(guò)去的10到12年,這些事情都在不斷地發(fā)生,每年都有一些藥物順利進(jìn)入(市場(chǎng)),但卻被迫召回或者大幅減少使用。”位于英國(guó)卡迪夫的GE Healthcare 公司生命科學(xué)部門(mén)首席科學(xué)家Stephen Minger說(shuō)。
         
        這一問(wèn)題來(lái)源于毒理學(xué)分析的缺陷。在標(biāo)準(zhǔn)的藥物獲準(zhǔn)過(guò)程中,研究人員在動(dòng)物和相對(duì)少部分人群中檢測(cè)藥物的毒性。動(dòng)物模型并不能準(zhǔn)確地代表人類的生理機(jī)能,并且臨床試驗(yàn)也很少能囊括體量足夠的群體來(lái)鑒定罕見(jiàn)的特異體質(zhì)的影響。
         
        最理想的解決方案是將真正的人類組織和器官在實(shí)驗(yàn)室中培養(yǎng),來(lái)模擬大量患者群體的生理機(jī)能,避免大規(guī)模臨床試驗(yàn)所帶來(lái)的成本和道德包袱。通過(guò)胚胎和最新的人類干細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù),毒理學(xué)家和細(xì)胞生物學(xué)家正在著手推動(dòng)這項(xiàng)工作。
         
        心臟技術(shù)
         
        傳統(tǒng)上而言,毒理學(xué)家能夠檢測(cè)永生化細(xì)胞系和原代組織培養(yǎng)中的組分。永生化細(xì)胞系是實(shí)驗(yàn)室內(nèi)有效的腫瘤細(xì)胞,僅與機(jī)體中的細(xì)胞有一點(diǎn)相似。原代培養(yǎng)物可以更加逼真地代表組織的正常生理狀態(tài),但存活時(shí)間卻無(wú)法滿足延伸實(shí)驗(yàn)。
         
        干細(xì)胞結(jié)合了這兩種培養(yǎng)的優(yōu)點(diǎn),能夠持續(xù)進(jìn)行培養(yǎng),并且能夠誘導(dǎo)分化成各種實(shí)際的組織。大約5年前,Minger和同事開(kāi)始探索這些特性,用于研發(fā)藥物毒性的新分析方法。“我們將人類胚胎干細(xì)胞轉(zhuǎn)變成大量的成人心肌細(xì)胞,并且我們和客戶都可以完全對(duì)其進(jìn)行預(yù)測(cè)。”Minger接著說(shuō),“至少在回顧性的分析中,我們能夠在(美國(guó))食品藥品監(jiān)督管理局的召回藥中發(fā)現(xiàn)毒性成分,這之前(的傳統(tǒng)分析中)卻沒(méi)發(fā)現(xiàn)一點(diǎn)毒性。”一些制藥公司在研發(fā)過(guò)程中開(kāi)始使用GE公司的Cytiva心肌細(xì)胞分析法來(lái)檢測(cè)藥物。
         
        其它公司也開(kāi)始研發(fā)基于干細(xì)胞的心肌毒性分析法。例如,位于美國(guó)威斯康辛州麥迪遜市的Cellular Dynamics 公司,提供了一種在誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞(induced pluripotent stem,iPS)中獲得的iCell競(jìng)爭(zhēng)性心肌細(xì)胞系。不同于胚胎干細(xì)胞,誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞來(lái)源于成年志愿者。生長(zhǎng)因子的組合將成人細(xì)胞變成了一種類似胚胎的狀態(tài),這樣就能指導(dǎo)其分化成所有主要的組織類型。
         
        對(duì)于想要自己研發(fā)干細(xì)胞分析法的研究人員來(lái)說(shuō),可選擇的試劑非常多。如今,常規(guī)的實(shí)驗(yàn)室供應(yīng)公司都提供干細(xì)胞培養(yǎng)基,法國(guó)巴黎的Cellectis公司和英屬哥倫比亞溫哥華市的Stem Cell Technologies公司等專業(yè)型公司也涉足這一領(lǐng)域。無(wú)論選擇何種路徑,分析法的研發(fā)人員都必須解決一些問(wèn)題,才能研發(fā)出有效的毒理學(xué)工具。盡管很多將干細(xì)胞分化為特定組織的步驟都似乎夠直接,得出的細(xì)胞卻往往會(huì)處于非成熟狀態(tài),并且與部分分化的母細(xì)胞混在一起。
         
        制藥研究的分析也必須保持一致,這也是干細(xì)胞領(lǐng)域的一大主要挑戰(zhàn)。“我們用于產(chǎn)生(干)細(xì)胞的大量試劑都眾所周知的易變。”Minger說(shuō)。為了解決這些問(wèn)題,他的團(tuán)隊(duì)將心肌細(xì)胞分化的過(guò)程分成了單個(gè)步驟,然后分離和控制盡可能多的變異。結(jié)果形成了一條生產(chǎn)線,產(chǎn)生的培養(yǎng)物能夠保證至少50%的細(xì)胞是成熟的心肌細(xì)胞。
         
        藥物與發(fā)展
         
        基于干細(xì)胞固有的生物學(xué)特性,產(chǎn)生完全成熟的成人細(xì)胞未來(lái)仍有可能是一大挑戰(zhàn)。“干細(xì)胞??實(shí)際是為了更好地形成胚胎,并為生命的最初嘗試建造機(jī)體。”美國(guó)康涅狄格州格羅頓市輝瑞公司高級(jí)研究員Robert Chapin說(shuō)。然而,對(duì)于研究發(fā)育毒性的Chapin和他的同事而言,干細(xì)胞衍生組織的不成熟性是一種特性而非缺陷。
         
        實(shí)際上,對(duì)于確定組分是否對(duì)發(fā)育中的胎兒具有毒性來(lái)說(shuō),干細(xì)胞系統(tǒng)應(yīng)該說(shuō)是近乎理想的系統(tǒng),特別是如果研究人員能將多個(gè)組織的生物學(xué)特性融入到單個(gè)培養(yǎng)物中。“其中一個(gè)(目標(biāo))是將來(lái)源于干細(xì)胞的多種細(xì)胞型放入3-D培養(yǎng)物中,這是因?yàn)檫@些細(xì)胞無(wú)法分開(kāi)操作。”輝瑞公司高級(jí)首席科學(xué)家Donald Stedman說(shuō)。
         
        輝瑞公司目前已將自己基于鼠源干細(xì)胞的檢測(cè)融入到其藥物研發(fā)流程,檢測(cè)發(fā)育毒性。監(jiān)管部門(mén)十分依賴于小鼠和家兔的臨床前數(shù)據(jù),以預(yù)測(cè)藥物對(duì)于人類的發(fā)育影響,而不是堅(jiān)持對(duì)孕婦進(jìn)行臨床實(shí)驗(yàn)。對(duì)于小鼠胚胎有毒的藥物是不會(huì)得到批準(zhǔn)用于孕婦的,因此公司就想要清除可能在小鼠中失敗的組分。
         
        為了核實(shí)這一分析方法,Chapin的團(tuán)隊(duì)檢測(cè)了之前在動(dòng)物身上研究過(guò)的超過(guò)90種組分,這一團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),干細(xì)胞分析和真實(shí)的發(fā)育毒性結(jié)果存在近乎完美的一致性。“我們使用一種干細(xì)胞分析,幫助我們鑒定那些明確具有毒性、明顯不需要再繼續(xù)推進(jìn)的組分,如果我們夠幸運(yùn),通過(guò)這一方法檢驗(yàn)一個(gè)未知的組分,并得到清晰的結(jié)果,那么就可以輕松給予它良好的健康證明書(shū)。”Chapin說(shuō)。
         
        這種極端的結(jié)果與其說(shuō)是規(guī)則,不如說(shuō)是例外。更普遍的是,調(diào)查者發(fā)現(xiàn)新的組分在一定劑量下表現(xiàn)出一定的毒性。“在實(shí)際情況下,我們最后需要做出判斷,并且討論概率。”Chapin解釋說(shuō)。
         
        缺乏經(jīng)驗(yàn)和概率性的干細(xì)胞分析結(jié)果推遲了它們的應(yīng)用。“我得說(shuō),在制藥商的群體中(基于干細(xì)胞的分析)有相當(dāng)大的阻力,因?yàn)樗麄儾淮_定(這種技術(shù))正在告訴他們什么。”GE公司的Minger表示。例如,他接著說(shuō),“如果你看到一個(gè)組分在我們的(Cytiva)細(xì)胞上是有毒的,但在其它所有標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試中都是無(wú)毒的,你該相信誰(shuí)?”
         
        干細(xì)胞分析的早期支持者確信,隨著更多數(shù)據(jù)的出現(xiàn),這些擔(dān)憂會(huì)逐漸消退。研究人員也可能會(huì)因?yàn)楦杉?xì)胞分析的獨(dú)特性能而改變想法,例如更直接地檢測(cè)人類的發(fā)育毒性。“我希望在發(fā)育毒性方面,可以研發(fā)出使用人類胚胎干細(xì)胞進(jìn)行預(yù)測(cè)的分析方法,那樣我們就能判斷出,比起我們使用的(動(dòng)物)系統(tǒng)來(lái)說(shuō),這種方法具有更高或更低的價(jià)值。”Stedman說(shuō)。
         
        團(tuán)隊(duì)努力
         
        在歐洲,使用干細(xì)胞替代動(dòng)物檢測(cè)也很風(fēng)靡。2011年,歐盟委員會(huì)和一個(gè)化妝品制造商聯(lián)盟聯(lián)合資助了一個(gè)安全評(píng)價(jià)最終替代動(dòng)物實(shí)驗(yàn)(Safety Evaluation Ultimately Replacing Animal Testing,SEURAT)的項(xiàng)目,這一項(xiàng)目包含了若干個(gè)大的研究計(jì)劃,旨在制定化妝品和其它化學(xué)品的替代性安全檢測(cè)。同時(shí),歐洲當(dāng)局也開(kāi)始限制動(dòng)物實(shí)驗(yàn),最終于2013年3月通過(guò)了一項(xiàng)全歐洲的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)化妝品銷售禁令。
         
        在SEURAT的群體中,相關(guān)、高效和標(biāo)準(zhǔn)化的毒理學(xué)干細(xì)胞研究計(jì)劃(Stem Cells for Relevant, Efficient, and Normalized Toxicology,SCR&Tox)完全聚焦于研發(fā)基于干細(xì)胞的毒性檢測(cè)方法,共有五種組織類型:心臟、肝臟、肌肉、皮膚和神經(jīng)。盡管SEURAT計(jì)劃由化妝品公司資助,制藥研究人員也會(huì)發(fā)現(xiàn),許多SCR&Tox的檢測(cè)方法也適用于他們。“SEURAT項(xiàng)目集群的目標(biāo)是替代活體內(nèi)重復(fù)劑量的毒性檢測(cè)。”SCR&Tox的項(xiàng)目經(jīng)理Vania Rosas說(shuō)。
         
        為此,SCR&Tox項(xiàng)目研究者一直致力于將誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞(iPS)分化至項(xiàng)目所研究的5個(gè)成熟的組織類型。Rosas說(shuō),他們遇到了許多其他研究者具有的相同問(wèn)題,尤其是干細(xì)胞即使經(jīng)過(guò)分化后,仍然趨向于保持非成熟的特性。盡管如此,SCR&Tox研發(fā)的檢測(cè)方法將很快找到它們的方式,以入主用于檢測(cè)和確證的工業(yè)實(shí)驗(yàn)室,Rosas希望監(jiān)管機(jī)構(gòu)能夠在幾年內(nèi)開(kāi)始接受基于干細(xì)胞的化妝品毒性數(shù)據(jù)。
         
        另一項(xiàng)大規(guī)模的歐洲研究計(jì)劃StemBANCC也致力于提高毒理學(xué)分析中的干細(xì)胞使用。就在SCR&Tox的研究人員研發(fā)基于健康志愿者身上提取的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的通用毒理檢測(cè)方法時(shí),StemBANCC的科學(xué)家則聚焦于來(lái)源于500個(gè)患有各種疾病的患者身上的誘導(dǎo)多能干細(xì)胞。這些疾病特異性的細(xì)胞將形成新一代藥物研發(fā)分析的基礎(chǔ),包括毒理學(xué)檢測(cè)。
         
        “新一代的誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞還只是一項(xiàng)技術(shù)目標(biāo)。更重要的(是)將它們分化成與疾病相關(guān)的細(xì)胞形態(tài)??隨后試著在培養(yǎng)皿中理解這個(gè)疾病。”瑞典巴賽爾Hoffmann-La Roche公司的干細(xì)胞平臺(tái)負(fù)責(zé)人Martin Graf說(shuō),他也是StemBANCC項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人之一。
         
        除了細(xì)胞樣品外,StemBANCC項(xiàng)目也將從病例中收集詳細(xì)的臨床數(shù)據(jù)。“這一計(jì)劃的其中一件大事是臨床表型的深度,這是我們將要在病人身上操作的。我覺(jué)得隨后細(xì)胞系的真正價(jià)值是得到表型信息。”StemBANCC的學(xué)術(shù)主任、英國(guó)牛津大學(xué)Nuffield學(xué)院臨床神經(jīng)科學(xué)教授ZameelCader說(shuō)。除了診斷和歷史外,每個(gè)StemBANCC生產(chǎn)線都將伴隨著診斷檢測(cè)帶來(lái)大量的數(shù)據(jù),體現(xiàn)病人的病程、治療手段和藥物反應(yīng)。
         
        最終,該計(jì)劃尋求為制藥研究人員提供真實(shí)的個(gè)體病人的實(shí)驗(yàn)室模型,在新藥到達(dá)臨床前就能得到針對(duì)有效性和毒性的更可靠預(yù)測(cè)。“我認(rèn)為使用源于病人材料的體外毒理學(xué)確實(shí)是試著解決藥物研發(fā)過(guò)程中藥物脫靶的第一步。”Cader說(shuō)。
         
        芯片上的大腦
         
        其他研究者正在將“培養(yǎng)皿中的病人”這一概念更進(jìn)一步,試著在類似器官的3-D培養(yǎng)物中讓多種組織類型生長(zhǎng)在一起。瑞士貝爾蒙的西瑞士應(yīng)用科學(xué)大學(xué)組織工程學(xué)教授Luc Stoppini最初在對(duì)傳統(tǒng)干細(xì)胞培養(yǎng)失望后,開(kāi)始了這一研究計(jì)劃。“他們宣稱得到了(干細(xì)胞誘導(dǎo)的)神經(jīng)元,因?yàn)樗鼈儽磉_(dá)的beta-3微管蛋白基因是神經(jīng)元的標(biāo)記之一,但當(dāng)我看到它們時(shí),它們就像成纖維細(xì)胞,不具有分化的軸突、神經(jīng)突起和突觸。”Stoppini說(shuō)。
         
        作為神經(jīng)生物學(xué)家,Stoppini想要更加真實(shí)的神經(jīng)系統(tǒng)。讓干細(xì)胞誘導(dǎo)的“神經(jīng)元”長(zhǎng)在3-D的培養(yǎng)系統(tǒng)中,將引導(dǎo)它們發(fā)育出更多的神經(jīng)元形態(tài),細(xì)胞也開(kāi)始能夠傳導(dǎo)電信號(hào)。竅門(mén)在于讓3-D培養(yǎng)比傳統(tǒng)平板培養(yǎng)長(zhǎng)得更長(zhǎng)(神經(jīng)元通常在幾個(gè)月內(nèi)持續(xù)發(fā)育)。“我們確實(shí)需要時(shí)間去得到人類神經(jīng)元的功能。”Stoppini說(shuō)。他接著表示這一緩慢的發(fā)育會(huì)使得等比擴(kuò)大某些分析,以達(dá)到制藥公司的高通量需求變得十分困難。
         
        然而,讓這一系統(tǒng)發(fā)揮作用的回報(bào)也可能很大。特別是,Stoppini說(shuō),長(zhǎng)期的培養(yǎng)能夠發(fā)育出一些非神經(jīng)的細(xì)胞型,它們對(duì)于正常神經(jīng)系統(tǒng)的功能來(lái)說(shuō)也是尤為重要的,例如星形膠質(zhì)細(xì)胞和少突細(xì)胞。他的團(tuán)隊(duì)現(xiàn)在從胚胎細(xì)胞和誘導(dǎo)性多能干細(xì)胞中都能得到這些小型的腦組織,從而提高了模擬來(lái)自于患者細(xì)胞的特定神經(jīng)疾病的可行性。
         
        研究人員也將這一步驟繼續(xù)向前推進(jìn),將3-D腦培養(yǎng)物長(zhǎng)在點(diǎn)滿了電子感應(yīng)器的微流控芯片上。當(dāng)感應(yīng)器記錄電活動(dòng)的時(shí)候,微毛細(xì)管就為培養(yǎng)物帶來(lái)了新鮮的營(yíng)養(yǎng)。
         
        Stoppini也將腦芯片與其他干細(xì)胞誘導(dǎo)的微流控器官培養(yǎng)物交聯(lián)。未來(lái)的藥物研究者能夠?qū)?shí)驗(yàn)藥物喂飼進(jìn)源于患者的腸子中,然后通過(guò)血管系統(tǒng)將它的代謝物傳遞到微型的肝臟中,最終影響體外大腦的活性。“我們的終極期望是得到我們稱為21世紀(jì)的培養(yǎng)皿,它將具有嵌入在生物芯片中的培養(yǎng)物,在那兒所有的生物傳感器??都整合在一起。”Stoppini說(shuō)。
         
        該技術(shù)最新的循環(huán)也引入了無(wú)線局域網(wǎng)的發(fā)射器,這樣研究人員不用打開(kāi)孵化器就能監(jiān)測(cè)系統(tǒng)。Stoppini接著說(shuō),“這是一個(gè)不尋常的時(shí)期,它通過(guò)整合生物學(xué)工具(和電子學(xué)),打開(kāi)了新的研究途徑??因此我們能夠真正地瞥見(jiàn)這些事物是如何工作的。”

         

         

         

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        細(xì)胞治療使用的 lonza 04-418Q 無(wú)血清培養(yǎng)基 (點(diǎn)擊標(biāo)題進(jìn)入)

         

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